男孩遗精正常不会导致头痛，但是频繁地遗精会引起注意力不集中。
男孩遗精会导致精神萎靡不振，直接危害到男孩的正常生长发育，还会影响男孩的学习，严重甚至影响男孩的生理功能，但是对于青春期的男孩，没有性生活，生理性遗精属于正常现象，对身体没有明显危害。
但是针对频繁遗精的患者，一周遗精几次可能会产生负面反应，尤其是病理性遗精会导致患者身体不适感，例如乏力、腰膝酸软等。虽然病理性遗精会导致患者身体出现不适感，但是并不会产生头痛症状，所以男孩遗精和头痛没有直接的关系。