阴茎长小疙瘩可能是珍珠疹、尖锐湿疣、炎性结节、阴茎肿瘤等原因导致。
珍珠疹也叫玫瑰疹，主要表现在阴茎和冠状沟有凸起的小疙瘩。不会产生临床症状，也不会对人体造成危害，不用特殊的处理，平时注意阴茎的清洁即可。
如果有不洁的性生活史，感染了人乳头瘤病毒，在阴茎表面形成尖锐湿疣。主要表现为肉粒状的疙瘩凸起，逐渐增大、增多时，可呈鸡冠状伴有阴茎瘙痒。确诊后需要给予理疗、激光、手术等方式治疗。
包皮龟头经常发炎，引起炎症性的结节、阴茎肿瘤，也会出现小肉疙瘩凸起。