胃窦增厚胃癌发生的几率还是比较大。这是因为胃癌的患者，由于癌细胞对于黏膜的刺激损伤作用，黏膜会发生增生等反应，从而导致胃的局部病变区域增厚的表现。
还有一些胃部的疾病也可以出现胃窦增厚，例如发生于胃窦部的淋巴瘤或者是一些慢性肥厚性的胃炎疾病，也有可能会出现胃窦的增厚。但是研究证实后两种疾病所造成的胃壁增厚的发生几率并不是很大。
为了明确具体造成胃窦增厚的原因，可以对增厚的胃窦区域进行反复多点的多次活检来获取标本。根据标本的最终病理免疫组化结果，判断胃窦增厚区域的性质。