急性扁桃体炎是有自愈倾向的。
急性扁桃体炎大部分是由于细菌和病毒感染引起的。如果病情轻微是不需要进行特殊的治疗，可通过机体的免疫力和抵抗力就可以自愈。如果扁桃体炎全身症状明显，病情较重，自愈的可能性不大，需要进行系统的口服或者静脉的药物治疗。包括抗感染治疗，常用药包括头孢呋辛、青霉素钠、左氧氟沙星、阿奇霉素等。退热治疗包括赖氨匹林、对乙酰氨基酚、布洛芬混悬液等。
如果扁桃体炎反复发作，形成慢性扁桃体炎，建议行扁桃体切除术来进行治疗。