尿路感染时，致病菌有可能会造成临近的肛门皮肤感染，从而引起肛门瘙痒。尿路感染时尿液中含有较多的细菌，由于肛门与尿道口距离非常近，所以尿道口的细菌有可能移行到肛周皮肤，引起肛周皮肤的感染，导致肛门瘙痒。
特别是女性，由于生理解剖的关系，尿道口距离肛门非常近，引起肛门感染、瘙痒的概率非常大。当肛门皮肤感染时，会出现破溃渗液，持续的潮湿瘙痒刺激，可能会导致急性湿疹的发生，引起瘙痒。
当皮肤破损愈合时，肉芽组织会刺激肛门皮肤神经，引起瘙痒感。