宝宝扁桃体炎发炎的一个病因是上火，此外还受其它因素影响。上火会引起咽部不适、咽干、咽部疼痛等症状。症状进一步进展，会引发扁桃体发炎，出现扁桃体充血、肿胀、疼痛等临床表现。
扁桃体发炎还与其他因素有关，比如机体免疫力下降，会引起咽喉部病原体大量繁殖，导致扁桃体炎。细菌或者病毒感染，机体遭受病原体侵入，比如非溶血性链球菌、腺病毒等，可以导致扁桃体发炎。继发于其它疾病，比如白喉、猩红热等疾病。
一些刺激因素，也容易诱发扁桃体炎，比如烟雾刺激、寒冷、劳累等。