血吸虫病能否根治，要看患者感染的程度，治疗是否彻底与及时治疗有关。
如果是急性血吸虫病患者，经过及时、有效的病原学治疗，大多数可以痊愈。如果是慢性患者，在慢性早期时接受了病原学治疗，大部分患者粪便中虫卵可以转为阴性，症状可以消失，体力有所改善并可以长期保持健康状态。
但如果患者发展为晚期血吸虫病，并且已经出现了严重的并发症，如肝硬化、上消化道出血、肝性脑病、感染、肠道并发症等情况，虽然经过病原学治疗，但是肝硬化难以恢复，无法根治。