脂肪肝中有一部分是由肥胖导致的，而其他部分的脂肪肝不是由肥胖导致。
由肥胖导致的脂肪肝是非酒精性脂肪肝，也就是营养过剩导致脂肪在肝脏内大量堆积而形成脂肪肝。但是也有其他因素可以引起脂肪肝，例如酒精可以形成酒精性脂肪肝，人体长期摄入酒精超过5年，往往就会形成酒精性脂肪肝。
此外，还有药物也可以引起脂肪肝，不同的药物可以使肝细胞发生脂肪变性，出现凋亡、坏死，从而形成药物性脂肪肝。
不同的脂肪肝形成的原因有区别，但是治疗上都是通过饮食控制和运动疗法，使脂肪肝逐渐得到逆转。最重要的前提是中断引起脂肪肝的原因，如进行戒酒和停止服用引起脂肪肝的药物等。