肾旋转异常的治疗方法，要根据肾旋转异常导致的症状而定。肾旋转异常会出现两种变化，一是肾脏的旋转角度异常，旋转的角度越大，对肾脏的影响越大；二是肾脏发生旋转会导致肾盂、输尿管系统出现发育的异常。
肾旋转异常会导致尿液的排出系统出现狭窄，轻度狭窄症状较轻，不需要特殊的治疗。如果狭窄较重，会使尿液排出的阻力增大，可以出现肾积水的症状。
如果输尿管狭窄不治疗，肾积水的症状无法缓解，还有可能出现肾功能受损，故狭窄严重的要进行手术治疗。