对于胚胎停育的女性，如果检查以后，是因为胎儿染色体异常，而导致的胎停，那通常都要先终止妊娠，将胚胎从宫腔内排出。可能是先需要服用米非司酮片，再服用米索前列醇片，等到规律宫缩以后，就能够将胚胎及其附属物一起排出。
同时还可能要在胚胎和附属物排出后，需要进行清宫手术操作，将宫腔内的残留组织清除干净。而且对于这类女性，可能没办法再次自然、正常受孕，因为再次怀孕，又可能因为染色体发育异常而导致胚胎停育。
多需要考虑进行三代试管婴儿移植受孕，在做试管婴儿移植的时候，要选择胎儿的正常发育的染色体。