急性细菌痢疾通常需要通过临床症状，以及辅助检查进行鉴别诊断。
在临床症状方面，细菌性痢疾通常存在不洁饮食诱发因素，同时其临床症状可包括发热、寒战等全身性体征，以及脓血便、呕吐等消化道症状。
在化验室检查方面，通常可存在白细胞升高、中性粒细胞比例升高、C-反应蛋白、血沉等炎性指标升高表现，粪便常规可发现较多脓细胞以及红细胞。如粪便细菌涂片以及细菌培养可发现痢疾杆菌，可作为明确诊断指标。