心脏黏液瘤的发病机制并没有完全地明确，考虑跟以下的因素有关系：
一、遗传，有一部分的患者存在家族遗传性。
二、机体免疫功能异常，导致间叶细胞发生分化向心腔内生长，逐渐形成心脏黏液瘤。
三、平时不良的饮食和生活习惯，如重口味饮食、过多的吸烟和饮酒等，会使该病发生的风险明显增大。
对于发生心脏黏液瘤的患者，要及时地给予手术治疗，尽快把黏液瘤去除，以免黏液瘤出现恶变，造成外周栓塞或者黏液瘤堵塞瓣膜口，阻塞心脏血流，引起猝死发生。