脑疝的病因主要为脑内疾病引发占位性病变，外伤引发颅内血肿以及医源性因素。
临床上较为常见的脑出血及大面积脑梗死会导致颅内压急剧升高，使脑组织、脑神经以及脑血管很多部位受压产生移位，容易导致脑疝。
脑部出现良性肿瘤或恶性肿瘤，当体积逐渐增大到某种程度时，就会造成占位性的病变，使周围脑组织产生水肿引发脑疝。脑部受到外伤引发颅内血肿时，也容易造成脑疝。
此外，医源性因素引发脑疝，主要是由于颅内压增高的患者在进行腰椎穿刺的时候，放出的脑脊液过快过多，也容易诱发脑疝。