临床上造成大小便失禁的原因较多，大脑为控制大小便的高级中枢，脊髓为控制大小便的低级中枢，人体的低级中枢主要位于腰骶部，其功能主要受高级中枢的支配和控制。因此，当大脑和脊髓损伤后，都会造成大小便失禁。
神经系统疾病可引起大小便失禁，比如脑肿瘤、脑萎缩、脑外伤、脑卒中等，都可能会导致控制大小便的中枢系统受损，而诱发大小便失禁。
另外，先天性发育畸形，比如尿道畸形、肛门、直肠畸形，或者是神经系统发育缺陷等，都可能会使人体的感觉和运动系统受损，导致大小便失禁。