小肠血管瘤是先天性的小肠血管畸形所致，属于小肠间叶组织的良性肿瘤。血管瘤中有很多扩张和扭曲的血管，这些血管形态和功能异化，同时伴随着脂肪组织的增生，会增加血栓形成的概率，并破坏周围的正常解剖组织，这些多种异常的血管生理构成的小肠血管瘤的病态结构。
该病多发生于黏膜下血管丛，少数会发病于浆膜下，主要累及的是空肠和回肠，部分可累及到肠黏膜和肠系膜，本病发生于十二指肠的非常罕见。
小肠血管瘤可以单发也可以多发，甚至可能遍布全小肠。