颅底恶性肿瘤在早期通常没有明显的临床症状，只有当肿瘤发展到一定程度时，则会根据肿瘤的具体位置而表现出相关的临床反应。
例如鼻咽区的肿瘤会导致患者出现涕中带血。耳咽鼓区的肿瘤可以使患者出现耳鸣、听力下降。小脑部位的肿瘤会导致患者出现共济失调的症状。如果肿瘤发生于颈静脉孔区，则会影响迷走神经、副神经以及舌咽神经。
颅底恶性肿瘤其恶性程度通常比较高，并且由于位置比较特殊，治疗相对比较困难，建议患者在早期及早发现，及时进行治疗。