治疗病毒性脑炎要住院多久，并不能一概而论，需要依据患者的病情程度来决定。
如果是轻度的病毒性脑炎，患者仅表现为低热、头痛，通过腰椎穿刺检查细胞数和蛋白质都不是很高。针对这种情况，一般经过合理规范化治疗，可使发热、头痛症状很快得到缓解。通常在一周后复查腰椎穿刺，如果细胞数和蛋白均属于正常，再巩固治疗一周左右，可考虑出院。
如果患者的病情比较严重，存在剧烈的头痛以及频繁的呕吐症状，并伴有高热，同时还存在癫痫、病毒性心肌炎等并发症。这种情况的患者住院时间较长，经过科学对症治疗，需要等到细胞数、蛋白质和心肌酶正常后，才可考虑出院。