神经衰弱的治疗主要靠药物，此类药物包括非苯二氮卓类，如右佐匹克隆、酒石酸唑吡坦等，以及苯二氮卓类，如阿普唑仑，奥沙西泮等。
通常右佐匹克隆起效快，没有成瘾性，但持续时间较短5~6小时。而阿普唑仑起效慢，持续时间较长，但有成瘾性。一般短期失眠会选用非苯二氮卓类，服用两周，两周后按需服用，而长期失眠者则更倾向于选择阿普唑仑。
神经衰弱除了服用药物还可以进行心理治疗，主要是认知行为治疗（CBT—I），一般包括睡眠卫生教育、刺激控制疗法、睡眠限制疗法、认知治疗和松弛疗法。