近些年，随着心电图的广泛应用早期复极综合征的检出率不断提高，认为可能与迷走神经张力增强有关，这种改变应属于正常变异。发生机制迄今尚未阐明，可能与下列因素有关：
1.心肌：心电复极的变异有人认为早期复极综合征系因部分心肌在整个心室除极尚未结束，提早复极的结果，多见于前壁心外膜下心肌故ST段移位以V2～V4为显著因而称之为早期复极综合征。
2.交感神经兴奋性：与自主神经功能紊乱有关。早期复极综合征多见于健康青壮年运动员，绝大多数有心动过缓，睡眠时ST段升高更为明显。但用阿托品并不能使早期复极综合征的特征性心电图消失而运动或体力应激时随心率增快ST段可降至正常甚至全部早期复极综合征的特征消失，故与交感神经兴奋性升高，迷走神经的影响减弱有关。
3.先天性因素：国内有报道一家兄弟7人均有家族性早期复极综合征故，不排除早期复极综合征有先天性因素和遗传因素有关。