对于脑积水的治疗主要是以手术治疗为主，包括病因治疗、减少脑脊液生成及脑脊液分流手术三种。
比如如果对于梗阻性脑积水，解除梗阻的病因是最为理想的方法。比如中脑水管成形术或者扩张术、第四脑室正中孔切开或者成形术、枕骨大孔先天性畸形者进行颅后窝及上颈椎椎板减压术、切除阻塞脑脊液流通的肿瘤、囊肿等，对于缓解脑积水都是有帮助的。
因此，治疗上首先必须针对病因治疗。其次，可以考虑进行减少脑脊液形成的手术，比如侧脑室脉络丛切除或者电灼术。另外可以考虑进行脑积液分流手术及辅助药物治疗。