慢性阻塞性肺疾病主要与以下疾病进行鉴别。
第一、支气管哮喘，该病多在儿童或青少年期起病，以发作性的喘息、气急为特征，发作时两肺可闻及哮鸣音，常有家族史或个人过敏史，经治疗可缓解或者是自行缓解，其气流受限多为可逆性，支气管舒张实验阳性。
第二、支气管扩张，患者多有反复发作的咳嗽，咳痰病史，常伴有咯血，合并感染时，咳大量的浓痰，胸部x线检查显示肺纹理增粗紊乱，高分辨CT检查提示支气管扩张的改变。
第三、弥漫性泛细支气管炎，该病大多数的为男性非吸烟的患者，几乎所有的患者均有慢性鼻窦炎，X线胸片及CT可见弥漫性的小叶结节影和过度充气征，红霉素治疗有效。
第四、支气管肺癌，患者可有刺激性的咳嗽，咳痰，痰中带血或慢性咳嗽，咳嗽性质发生改变，胸部CT检查可发现占位性病变，阻塞性肺不张或阻塞性肺炎。痰细胞学、纤维支气管镜或经皮肺穿刺活检有助于诊断该病。