自身免疫性肝炎没有潜伏期，潜伏期往往是针对感染性疾病。
肝脏受到病毒性肝炎或者其他嗜肝病毒的入侵后，有一段时间内没有任何临床症状，这段从感染到发病的过程称为潜伏期。自身免疫性肝炎并不是感染性肝病，而是自身免疫系统紊乱，导致肝脏成为自身免疫系统的攻击靶器官，从而形成肝脏的炎症。
自身免疫性肝炎只有静止期和活动期。活动期的自身免疫性肝炎往往会有转氨酶上升，抗核抗体指标出现异常。因此，对于活动期的自身免疫性肝炎，需要予以护肝降酶治疗，必要的时候还需要应用免疫抑制剂。