宫外孕流产会导致不孕不育，因为宫外孕流产时也会因为孕卵绒毛一直停留在输卵管内会导致反复出血现象，有可能会出现不完全性流产。
根据调查可发现宫外孕流产之后，如果没有彻底治疗，有20%的机会还会再次出现宫外孕，也有50%的机会会导致不孕不育，所以有宫外孕史的朋友平时应该注重随访检查。
宫外孕流产还可能会导致输卵管破裂，如果在最初时没有发现异常，一旦破裂就可能会伤及小动脉，导致急性出血，严重还会造成死亡，大约有1/3的宫外孕人群，就是因为出现休克才被紧急抢救。如果宫外孕后出现输卵管炎症，也会导致不孕不育。