制霉菌素是治疗小儿鹅口疮的一种常见药物，相比其他抗真菌药物，制霉菌素的副作用相对较小，一般在合理用药的情况下，一般不会对患儿身体造成太大影响。
因个人体质差异，大剂量用药或药物过敏者，可能会引起腹痛、腹泻、恶心、呕吐等不良反应，在停止用药后其症状通常能够得到良好的缓解和消失。
具体用药方法及注意事项，最好咨询医师进行明确，平时要加强患儿的生活护理，保证口腔卫生，辅食需以软糯、清淡类为主，适当给患儿进行补充水分。