肛窦炎是肛窦和肛瓣发炎也叫肛隐窝炎。现代医学认为粪便积存于肛窦内，有利于细菌的侵入和繁殖，从而导致受侵犯的肛窦产生炎症、感染、水肿及渗出。
肛门镜检查可见肛窦水肿，充血而且有压痛，有时可有脓性分泌物从窦口处流出。如果患有肛窦炎，应及时给予消炎处理以防感染加重，导致肛管直肠周围软组织发生感染，形成肛周脓肿。
规范的使用抗菌药物的前提，是首先要取肛窦处的分泌物，送检细菌培养及进行药物敏感实验。根据培养结果选择敏感的药物。如果没有进行细菌培养及药物敏感实验，根据临床用药经验，可使用头孢类的药物及左氧氟沙星。