无机磷和有机磷中毒的区别是接触的毒物不同。另外，患者的临床表现和症状也不同。
无机磷通常是通过皮肤接触、口服或误服含有无机磷类的物质而导致的急性中毒。患者通常相对的症状要比有机磷类症状相对较轻，没有明显的M样症状和N样症状的出现，但是也会伴随皮肤黏膜灼烧样的疼痛，具有明显的消化系统的症状、循环系统和神经系统的症状和体征。患者会有呼吸困难、头晕、头痛、心悸、胸闷、气短等一系列的临床表现。
而有机磷中毒患者会有瞳孔针尖样缩小、面色潮红、口唇分泌物增多、大汗淋漓、膀胱充盈等典型的症状。
除此之外，无机磷中毒和有机磷中毒治疗的药物种类也不尽相同。无机磷中毒以对症治疗为主，有机磷中毒是有一定的特效解毒药，例如阿托品、解磷定等。