脑干梗塞是由于椎基底动脉及其分支，有粥样硬化或动脉栓塞、痉挛、炎症导致管腔狭窄、缺血而引起的循环障碍，脑干是由中脑、脑桥还有延髓组成的，是呼吸、心跳、体温的调节中枢。
脑干梗死发生在不同的部位，遗留的症状和体征也不同，后遗症与脑梗死发生的部位、梗死的面积大小都有关系。
但是脑干梗死病情相对比较凶险，后遗症可以表现为交叉性的肢体感觉障碍、交叉性的运动障碍、偏瘫、患者头晕、走路不稳、语言不清、构音障碍，还有吞咽困难或者是饮水呛咳、视物双影、眼球震颤等后遗症。