肠息肉的主要检查方法是结肠镜检查，可以直接观察全部大肠的情况，可以诊断大肠炎症、息肉和肿瘤。发现了肠息肉可以观察息肉的大小、位置、数量、形态。
结肠镜还有治疗作用，可以电灼治疗肠道息肉。结肠镜检查前需要清洁灌肠，肠息肉还要做病理检查，肠镜下切除的息肉要及时做息肉活检，病理诊断结果对确定下一步治疗至关重要。
对于一些直肠息肉，还可做肛门直肠指诊检查。检查肠息肉的方法还有大便潜血试验、钡剂灌肠和腹部CT等方法。