流行性乙型脑炎恢复期的患者应当加强护理，防止并发症的出现，同时在饮食上要注意加强营养，这样才有利于病情的康复。
流行性乙型脑炎轻型和普通型的患者大多是可以顺利康复，而重型的患者病死率相对较高，主要会导致中枢性呼吸衰竭，因此针对恢复期的患者，加强护理尤为重要，尤其是要防止褥疮和继发的感染。
对于遗留语言、智力、吞咽和肢体功能障碍的患者要早期进行康复锻炼，这可以结合中医理疗、针灸、推拿、按摩的治疗手段。同时在恢复的过程中要注意加强营养，在饮食上做到荤素搭配，营养均衡，这样才有利于患者的病情康复。