阴囊湿疹和阴囊疥疮可从皮肤外观性状进行区别。前者常表现为皮肤外观红肿，可同时伴随皮肤渗液。而阴囊疥疮可见阴囊壁有皮损，呈现为针尖大小疱疹。
二者的另一区别是致病原因不同。阴囊湿疹常由过敏因素引起，而疥疮常有疥虫感染，属于传染性疾病。临床对皮肤直观检查时，可在皮肤部位发现疥虫。
治疗方法也有所不同。阴囊湿疹给以对症止痒以及抗过敏治疗，即可获得治疗效果。而疥疮给以硫酸软膏局部皮肤涂抹治疗即可。为了防止疥疮反复感染，换洗后的衣物需要煮烫处理。