小儿秋季老是腹泻严重，要根据其病因采取止泻、抗感染治疗。
秋季气温下降，容易着凉感冒，部分小孩的抵抗力比较低，腹部着凉引起的腹泻，可以通过局部热敷加快腹部的血液循环，结合应用蒙脱石散、双歧杆菌等药物止泻治疗。
消化不良引起的腹泻，可以服用四磨汤口服液、益生菌，必要时应用调理脾胃的中药，例如参苓白术散、小儿醒脾养儿颗粒等。
病毒感染引起的腹泻只能应用止泻药和益生菌对症治疗，严重时可静脉输液补充液体。
细菌感染引发的可给予头孢类或青霉素类的抗生素控制炎症，杀死细菌，达到止泻的效果。