呼吸不畅还咳嗽，可以在专业医师的指导下，口服止咳化痰的药物或者抗生素类的药物进行治疗。但具体的治疗方法，要根据引起呼吸不畅以及咳嗽的原因来做决定。
如果存在有支气管炎、肺炎或者急性渗出性胸膜炎引起，就需要口服抗生素类的药物。对于比较严重的咳嗽，也可以采用静脉输入药物进行治疗。
但如果引起的症状相对比较严重，就需要到医院做进一步的胸部CT检查，可以明确出呼吸不畅以及咳嗽的原因。然后再做对症的治疗，以免会延误病情，导致患者身体遭到更大的伤害。