直肠息肉和痔疮在发病部位、发病原因、临床症状以及预后等方面均有显著的差异。
痔疮生长在直肠下段黏膜以及肛管、肛门皮肤上，而直肠息肉可发生于任何部位的直肠黏膜上。痔疮一般是由于进食辛辣刺激性的食物等不良的习惯，引起的痔区静脉曲张。而直肠息肉多是由于长期接触有毒化学物质、慢性炎症的刺激以及遗传因素引起。
痔疮常可以引起肛门肿物、肛门疼痛以及大便带血等，不会发生恶变。直肠息肉可引起腹痛、腹泻、便血以及肛门坠胀不适等症状，有一定的几率发生恶变。