扁桃体结石一般不会发生癌变。
扁桃体结石是指在扁桃体上隐窝处，由于分泌物过多，隐窝长期处于堵塞状态，导致不易降解的钙镁等无机盐沉积，或细菌，或者在进食后食物残留物等，在扁桃体的血口处而形成的结石。而癌症主要是由于上皮细胞增殖分裂，引起病变所致，所以扁桃体结石不会引起癌变。
由于扁桃体结石的患者往往存在慢性扁桃体炎，所以治疗时使用抗生素治疗即可。若结石较大，引起堵塞不适，通常需要手术切除扁桃体才能根治。建议患者吃完饭后注意漱口、清淡饮食。