感染尼帕病毒可以影响生育，但并非常见后遗症。尼帕病毒感染对于生育的影响，通常是由于两方面因素诱发：
首先，人类与生育相关的组织器官内血管相对丰富，在被尼帕病毒感染后，可引起局部炎症表现，如感染程度较重，可导致局部组织破坏。
其次，尼帕病毒感染可诱发急性脑炎表现。如感染程度较重，可出现机体衰退症状，如短暂休克，在此情况下，患者全身血液供应会出现障碍，可对生育器官产生缺血缺氧性损伤，从而影响生育。