获得性免疫缺陷综合征相关的心血管损害，会出现心包积液、心内膜炎、心肌炎及心肌病、心脏肿瘤等。其治疗主要是以对症治疗为主。
心包积液，对于机会性感染和病原菌明确者，选用相应的抗生素，如抗结核治疗。如果胸痛可以使用非甾体类的镇痛药物，如阿司匹林等。心包穿刺可以解除心脏的压塞症状和减轻大量心包积液引起的压迫症状。外科手术治疗，对部分患者可以施行心包切开引流术和心包的切除术。
心内膜炎，治疗方面主要是根据血培养及药敏试验结果，选用有效的抗生素进行治疗。如果发生了左侧心内膜炎并发有严重的瓣膜反流，还需要手术治疗。
心肌炎和心肌病的病人，其治疗主要是避免心脏毒性的药物，避免糖皮质激素的使用。如果出现有充血性心力衰竭的临床症状或者是左心室扩大，或者是室壁运动减弱时，应该考虑停用非绝对必须的药物。还要注意抗机会性的感染的药物的潜在心脏的毒性作用。基本的处理方法，可以使用利尿剂、洋地黄、血管紧张素转换酶抑制剂等。
心脏肿瘤的治疗，主要是以对症化疗为主。