大多数的输尿管结石可以通过体外冲击波碎石的方法震碎。但是也有部分质地较硬的结石，可能一次碎石效果不佳，还需要二次碎石才可将结石震碎。
如果二次碎石仍然没有太好的效果，应当考虑输尿管镜碎石取石术。在将结石震碎以后，患者应当大量饮水，多排尿，多做跳跃运动，促进碎石向体外排出。
如果合并有感染，还应当口服抗生素类的药物控制感染。如果结石直径较小，主要是以药物排石为主，比如排石颗粒、尿石通等。在结石排出体外以后，腰腹部疼痛的症状会迅速消失。