生殖器整了疱疹的危害主要是会出现疼痛，影响生活质量，女性容易引发胎儿畸形。
生殖器上长的疱疹，一般指的是生殖器疱疹，为单纯疱疹病毒感染之后，引发的一种性传播疾病。正常的人群在得了生殖器疱疹之后，会导致生殖器部位反复出现伴随着灼热和疼痛的水泡，在复发期间会影响生活质量，不利于人体健康。而女性在妊娠期间，生殖器疱疹复发，有可能会使腹内胎儿生长发育受到影响，而引发畸形。
除此之外，在发病期间生产，可能会导致胎儿被传染上皮肤或黏膜的疱疹性疾病。